辣椒白粉虱：白粉虱俗称小白蛾，对辣（甜）椒等茄果类及瓜类、豆类蔬菜危害较重。成虫群集在叶背吸食汁液，分泌蜜露诱发霉污病，被害叶片褪绿、变黄，造成植株生长衰弱甚至萎蔫死亡，还可传染某些病毒病。防治白粉虱应提早规划与实施，重点在预防，采用综合措施，将发生危害降低到最小程度。
辣椒脐腐病：辣椒脐腐病，也称辣椒蒂腐病，是一种非侵染性的生理病害。果实顶部(脐部)呈水浸状，病部暗绿色或深灰色，随病情发展很快变为暗褐色，果肉失水，顶部凹陷，一般不腐烂，空气潮湿时病果常被某些真菌所腐生。
辣椒茎基腐病：本病多在幼苗定植后发生。茎基部发生暗褐色不规则病斑，向左右上下扩展，使茎基部皮层坏死，缢缩变细，地上部叶片萎蔫变黄，整株枯死。
辣椒疫病：染病幼苗茎基部呈水浸状软腐，致上部倒伏，多呈暗绿色，最后猝倒或立枯状死亡;定植后叶部染病，产生暗绿色病斑，叶片软腐脱落;茎染病亦产生暗绿色病斑，引起软腐或茎枝倒折，湿度大时病部可见白霉;花蕾被害迅速变褐脱落;果实发病，多从蒂部或果缝处开始，初为暗绿色水渍状不规则形病斑，很快扩展至整个果实，呈灰绿色，果肉软腐，病果失水干缩挂在枝上呈暗褐色僵果。辣椒疫病对产量、品质影响极大，严重时减产50%以上。
辣椒炭疽病：椒炭疽病主要为害将近成熟的辣椒果实，染病果实。炭疽病是辣椒上的常发病害，特别在高温季节，果实受灼伤，极易并发炭疽病使果实完全失去商品价值。辣(甜)椒炭疽病主要危害果实和叶片，也可侵染茎部。